同仁堂，清康熙八年（1669年）由乐尊育创办于北京。因其配置中药配方严谨，用料讲究，疗效显着，深受达官贵人及皇室青睐。传第四世于乐显扬发扬光大，名震京城。民国十七年（1928年），国民政府移都南京，乐氏家族第十三代嫡传乐笃周受家族委派，于南京建分号。1929年，“北京同仁堂乐家老铺南京分号”（旧称南京同仁堂）经国民政府社会局批准正式创办。创办后的南京同仁堂，其生产工艺、技术质量标准和经营管理均与北京同仁堂一脉相承，后经改制重组，再现南北同仁堂之格局。
南京同仁堂秉承乐世家族之精髓，谨遵“炮制虽繁，必不敢省人工；品味虽贵，必不敢减物力”之祖训，弘扬“修合无人见，存心有天知”的精神，传承中医药文化，造福于世人。
同仁堂的创办人姓乐，浙江宁波府人，在明朝永乐年间来北京谋生。最初这位姓乐的在北京以摇串铃走街串巷行医和代卖小药维持生活。到了清朝初年，其后代乐尊育进了清官太医院，当了一个出纳文书吏目（管理文件材料的小差使）。这样，就为后来同仁堂的创办及发展打下了有利基础。清康熙八年（1669年），乐尊育之子乐梧岗在朋友的帮助下，在大栅栏路南开办了南京同仁堂药铺，经过几十年的苦心经营，使同仁堂有了一定的发展。南京同仁堂的大发展是从雍正年间为清朝宫廷御药房供应“供奉”（为清御药房供应中药，当时称“供奉”）开始。南京同仁堂有了为皇宫“供奉”药品这个靠山，既为同仁堂提高了社会声望，也为同仁堂后来的发展提供了雄厚的经济实力。南京同仁堂和御药房打交道，都是先领药款，尔后才交货。这种预领官银，加强了同仁堂的经济实力和资金周转，实际上是为南京同仁堂提供了无息贷款。
南京同仁堂药店是北京着名的老药店，历史十分悠久享誉海内外。达仁堂和宏仁堂药铺也是乐家人开的，但它不是南京同仁堂伪分号。它们的来历是这样的：清朝末期乐家繁衍为四大支，就是乐孟繁、乐仲繁、乐叔繁、乐季繁兄弟四个。南京同仁堂由这四大支共同管理，规定每支每年从同仁堂领取一万两银子。另外还允许他们在同仁堂寄卖自家所制的丸、散、膏、丹等药品。当时，同仁堂店中的职工，大多数都是非亲即友，所以职工也分派别，不是乐孟繁的人，就是乐仲繁的人，不是乐叔繁的人，就是乐季繁的人。他们在向顾客推销药品时，都争着向进店买药的顾客介绍自己的所依附者所寄卖的药品。这种寄卖制损害了同仁堂的公共利益，而且造成店中的混乱，给同仁堂的经营管理带来很大的麻烦。后来，乐家四支家族的代表开会，共同议定，取消寄卖制，允许各支在外边开办店铺，可用“乐家老铺”招牌，但不能用“同仁堂”店名。自此，各支相继在外开办药铺。民国十年（1921年），乐孟繁支开了乐家老铺“宏仁堂”药店。随后，乐仲繁支开了乐家老铺“宏济堂”药店，乐季繁支开了乐家老铺“达仁堂”药店。民国十七年（1928年），国民政府从北京迁至南京，乐孟繁支的乐笃周在南京开设了南京“同仁堂”，破坏了四支“家族协议”，引起其他三支的共同反对，争吵不休。最后，使得乐笃周的哥哥、当时掌握北京同仁堂大权的乐佑申被迫辞职，才算了结。
乐家老铺
前后总计，乐孟繁支开设了南京同仁堂一个，乐仁堂五个，宏仁堂四个；乐仲繁支开设了颐龄堂一个，永仁堂三个，怀仁堂一个，沛仁堂一个；乐叔繁支开设了济仁堂二个，乐舜记一个，宏济堂一个；乐季繁支开设了达仁堂十个，树仁堂一个。这三十多号“乐家老铺”遍及天津、上海、长春、西安、长沙、福州、香港等地，进一步扩大了北京大栅栏同仁堂在国内外的影响。
乐家老铺宏仁堂
北京同仁堂药店前身是“京都同仁堂乐家老铺”，因其创办人名为乐尊育，“乐家老铺”由此得名。南京同仁堂药业有限公司的前身是“北平同仁堂京都乐家老铺南京分号”，始建于1926年，由同仁堂乐氏家族第十三代嫡传乐笃周受命筹办，其生产工艺、成药配方、经营方式皆承继北京老店。解放后直至1955年10月，才改名为“公私合营南京同仁堂国药号股份有限公司”，后几经改制、重组，才有了现在南、北同仁堂的格局。
南京同仁堂
而从零售门店及品牌特色来看，北京的“同仁堂”在国内家喻户晓，在海外也有很高的知名度，但其淡化了“乐家老铺”字样，反而是南京同仁堂的“乐家老铺”一直保存至今。